越來越多的研究者意識到同步記錄眼動和fMRI/MEG數據的重要性。眼動追蹤能夠監控被試在掃描過程中的任務卷入程度、監控可能的干擾因素（如眼跳和眨眼），并進行高級的數據分析，如注視鎖時(FIRE)的fMRI。眼動追蹤也讓注視關聯的刺激呈現成為可能，極大地擴展了研究者可探討的知覺和認知過程。EyeLink眼動儀是目前較為流行的fMRI和MEG兼容的眼動追蹤設備。
EyeLink 1000 Plus是MRI和MEG實驗環境下高精準和高采樣率的眼動儀；一套設備，兩種用途。用戶可以采用遠距支架及配套的高速圖像采集端和紅外光源在MRI/MEG環境下使用，用戶也可選配其他支架在行為實驗室使用。該設備適用于影像實驗室的其他特性包括：
兼容所有主要的MRI和MEG設備；
兼容多種頭線圈；
安裝簡便，用戶可快速完成被試設置；
采樣率高達2000 Hz（單眼），追蹤誤差低于0.5°；
鏡頭距眼睛的距離在60到150 cm之間；
追蹤視野達32° x 25°視角；
可選配940 nm紅外光源，適用于暗適應環境；
提供托盤支架和屏幕支架等多種支架，可與各種刺激屏幕搭配使用；
提供模擬信號輸出，可與MEG數據無縫同步記錄。
SR Research Experiment Builder讓研究者能夠快速開發實驗任務，并支持多種fMRI相關的觸發，便于刺激呈現和掃描周期同步。該軟件具有眾多適用于fMRI/MEG研究的特性。
提供數百種試驗任務模板，比如視覺搜索、點探測、變化視盲、線索任務等；
以毫秒級的計時精度呈現文本、圖片、視頻和音頻等刺激；
MRI的TR脈沖可以用以控制實驗進程并允許眼動和fMRI數據同步；
以毫秒級的計時精度記錄反應按鍵和聲音鍵觸發；
內置眼跳、注視、速度、邊界等觸發功能，便于快速開發需要實時眼數據的實驗任務；
支持與MRI/MEG及多種其他數據采集設備同步記錄。
除了Experiment Builder，用戶還可以給自己采用E-Prime、Psychtoolbox、Presentation等第三方軟件編寫的實驗任務快速添加眼動追蹤功能。
